Descifrado el genoma de uno de los linfomas m√°s agresivos

Octubre 23, 2013 Microciencia No Comments

Micrografía que muestra un linfoma de células de manto (zona inferior de la imagen) en una biopsia de íleon terminal. / Wikipedia

Micrografía que muestra un linfoma de células de manto (zona inferior de la imagen) en una biopsia de íleon terminal. / Wikipedia

FUENTE: SINC

El linfoma de células del manto es un cáncer muy agresivo y de difícil tratamiento originado en células de la sangre y de los ganglios linfáticos. Para identificar las alteraciones moleculares responsables de este tumor y facilitar el desarrollo de nuevos tratamientos, un equipo de científicos han secuenciado el genoma de más de 30 de estos linfomas.

El resultado de este trabajo, publicado hoy en la revista Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), presenta el primer an√°lisis gen√≥mico global de esta enfermedad. ‚ÄúEste estudio permite conocer mejor las causas y la evoluci√≥n de esta compleja neoplasia e identificar dianas para nuevos tratamientos‚ÄĚ, comenta S√≠lvia Be√†, primera firmante del estudio e investigadora del Hospital Cl√≠nic.

Los autores, de la Universidad de Oviedo y el hospital catal√°n, han analizado el genoma de las c√©lulas tumorales al inicio de la enfermedad y al cabo de varios a√Īos despu√©s del tratamiento, en el momento de la reca√≠da de la misma. De esta manera, se ha podido valorar las modificaciones en el genoma relacionados con la evoluci√≥n de la enfermedad.

Estos análisis han permitido descubrir diversos genes implicados en la progresión de estos linfomas y en la generación de mecanismos de resistencia a la quimioterapia. Además, se ha definido un grupo de pacientes con una evolución muy rápida de la enfermedad que presentan mutaciones en los genes NOTCH1 y NOTCH2.

Estas mutaciones pueden ser dianas terap√©uticas porque ya existen f√°rmacos que bloquean su actividad y podr√≠an ser √ļtiles en los casos m√°s complicados de linfoma de c√©lulas del manto. Tambi√©n se ha identificado un grupo de pacientes con un peque√Īo n√ļmero de mutaciones en el tumor y cuya enfermedad evoluciona muy lentamente. De esta manera, el conocimiento del genoma de estos linfomas puede orientar en la selecci√≥n de tratamientos m√°s adecuados para cada paciente.

“Estos estudios permiten la aplicaci√≥n de los estudios gen√≥micos en la pr√°ctica cl√≠nica para mejorar el diagn√≥stico y tratamiento de los enfermos de c√°ncer”, concluyen los autores.

El trabajo se ha llevado a cabo gracias a la financiaci√≥n de la Association for International Cancer Research (Reino Unido), la Lymphoma Research Foundation (EE UU) y el Instituto de Salud Carlos III (Espa√Īa) e ilustra c√≥mo las nuevas tecnolog√≠as de secuenciaci√≥n de genomas est√°n revolucionando el estudio y el conocimiento de distintos tipos de c√°ncer.

As√≠, durante los √ļltimos tres a√Īos el Consorcio para el Estudio Gen√≥mico de la Leucemia Linf√°tica Cr√≥nica, del cual tambi√©n forman parte estos investigadores, ha secuenciado el genoma de cientos de pacientes con la leucemia m√°s frecuente, identificando nuevos mecanismos de progresi√≥n tumoral y nuevas dianas terap√©uticas.

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Infraestructuras de investigación sólidas para el futuro

Octubre 22, 2013 Microciencia No Comments

FUENTE: Madri+d

El proyecto EuroRIs-Net+, que concluyó a finales de septiembre de 2013, se propuso desarrollar la red de Puntos de Contacto Nacionales del programa de Infraestructuras de Investigación (PCN de II). Estos PCN proporcionan asesoramiento, información práctica y asistencia en todo lo referente a la participación en los programas de financiación de la Unión Europea.

Entre los principales resultados del proyecto cabe citar la ampliaci√≥n de la cartera de servicios ofertados a las comunidades cient√≠ficas, las empresas y los estamentos p√ļblicos implicados en las II a nivel europeo e internacional. Esto fue posible gracias a la creaci√≥n de un Observatorio de Infraestructuras de Investigaci√≥n, una plataforma interactiva de informaci√≥n bien estructurada que permite acceder a datos integrados y actualizados sobre II, procedentes de fuentes nacionales y europeas, y que fomenta el di√°logo entre las distintas partes implicadas en dichas infraestructuras.

El Observatorio contempla varias temáticas: aspectos políticos, recomendaciones, informes, estudios, encuestas, artículos, planes de acción nacionales y regionales, planes de acción temáticos, indicadores en materia de investigación, fichas informativas de proyectos de II, presentaciones, información sobre entidades/organizaciones implicadas en las II, programas de financiación y oportunidades de acceso transnacional a las Infraestructuras de Investigación. La nueva sección de Visualización ofrece información sobre proyectos de Infraestructuras de Investigación organizada por entidades o por países implicados.

También se han introducido mejoras en el Foro para partes interesadas, que permite a sus miembros iniciar debates en línea y que cuenta ahora con nuevas funciones. Los usuarios externos podrán registrarse o presentar una solicitud para afiliarse al foro, así como participar en debates sobre II o plantear uno nuevo. Los miembros del Foro para partes interesadas también podrán subir documentos al Observatorio de II.

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‚ÄúNeurociencia y tecnolog√≠a pueden reducir las tasas de abandono escolar‚ÄĚ

Octubre 21, 2013 Microciencia No Comments

Karen M√°rquez, una de las ganadoras del TR35 Espa√Īa 2013 con su proyecto Infantium. / Domen√®c Umbert

Karen M√°rquez, una de las ganadoras del TR35 Espa√Īa 2013 con su proyecto Infantium. / Domen√®c Umbert

FUENTE: SINC

“Un perfil sorprendente y un esp√≠ritu emprendedor innato‚ÄĚ. As√≠ describe el jurado de los premios MIT Innovadores menores de 35 a Karen M√°rquez (Barcelona, 1979), periodista de formaci√≥n y una de las ganadoras de la edici√≥n espa√Īola en 2013. Su proyecto Infantium, que ya se encuentra en una fase previa a la comercializaci√≥n, es una plataforma basada en tecnolog√≠a cognitiva, inteligencia artificial e ingenier√≠a de datos para personalizar y adaptar el aprendizaje infantil.

¬ŅQu√© supone para Infantium este premio?

Es la verificaci√≥n de que estamos en el campo adecuado y que hay que seguir a pesar de todo. Han sido dos a√Īos muy duros. La gente nos dec√≠a ‚Äú¬°Qu√© hac√©is, si las cosas en educaci√≥n no le importan a nadie!‚ÄĚ. Que una instituci√≥n tan reputada considere que Infantium es una de las tecnolog√≠as del futuro ha dado mucha credibilidad y prestigio al proyecto.

¬ŅEn qu√© consiste?

Infantium es una plataforma de tecnología cognitiva y big data basada en neurociencia e investigación para personalizar el aprendizaje infantil. Analizamos sus interacciones a través de tabletas on line, aunque tenemos previsto recoger datos de otras fuentes, como Smart TV, relojes inteligentes Kinect, etc.

¬ŅC√≥mo se personaliza el aprendizaje con su m√©todo?

La idea es captar en todo momento c√≥mo interacciona el ni√Īo con diferentes contenidos y, con esos datos, saber c√≥mo ha aprendido, qu√© le falta por aprender y cu√°les son las actividades adecuadas seg√ļn sus capacidades. En funci√≥n de sus respuestas elaboramos un perfil cognitivo y trazamos su ruta de aprendizaje. Partimos de la base de que dos ni√Īos no son iguales ni aprenden de la misma manera.

Entonces, ¬Ņofrecen una plataforma de contenidos para mejorar el aprendizaje?

Nosotros no hacemos contenido, utilizamos contenido aportado por compa√Ī√≠as multimedia, desarrolladores o editoriales. El contenido es un canal para conocer exactamente el perfil cognitivo del ni√Īo. Infantium lo analiza de acuerdo con un modelo cient√≠fico desarrollado en colaboraci√≥n con la Universidad Aut√≥noma de Barcelona y la Universidad de Londres.

¬ŅC√≥mo naci√≥ esta aplicaci√≥n?

En 2011 mi socio Dani Gonz√°lez y yo nos dimos cuenta de que se estaban haciendo cosas para personalizar el aprendizaje en secundaria, pero nada en educaci√≥n infantil. Nos chocaba bastante porque los impactos durante los primeros cinco a√Īos de vida son fundamentales para el desarrollo posterior. Presentamos el proyecto en una feria internacional en Barcelona, ganamos el premio a la idea de mayor impacto futuro y empezamos a trabajar en ella. Conocimos a Carles Grau, director del Sector P√ļblico de Microsoft, que nos ayud√≥ mucho. En aquel momento se estaba haciendo mucha computaci√≥n basada en el cerebro y decidimos aplicar la idea a la educaci√≥n infantil.

¬ŅLa educaci√≥n formal no tiene en cuenta este tipo de necesidades?

El problema del sistema tradicional educativo en Primaria y Secundaria es que se ci√Īe a objetivos curriculares, est√°ndares que definen gobiernos y que cambian mucho de pa√≠s a pa√≠s. Trabajar con objetivos de desarrollo cognitivo tiene la ventaja de que son objetivos y muy globales.

¬ŅLos procesos de aprendizaje son comunes para todos los ni√Īos?

Eso es. El aprendizaje se basa en objetivos de desarrollo cognitivo que sientan las bases de las habilidades aritm√©ticas, la adquisici√≥n de lenguaje y estructuras matem√°ticas, la representaci√≥n mental de palabras y n√ļmeros, etc., que despu√©s se desarrollan con la edad.

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El Info quiere captar en tres a√Īos 90 empresas para el Parque Cient√≠fico

Octubre 17, 2013 Microciencia No Comments

El consejero Ballesta. :: I. S√°nchez/AGM

El consejero Ballesta. :: I. S√°nchez/AGM

FUENTE: Laverdad.es

La Ley de Emprendedores dispone desde ayer de un órgano tangible: el Consejo del Emprendimiento. El lugar donde se constituyó, en el Parque Científico del campus universitario de Espinardo, no fue elegido al azar, ya que esta infraestructura será uno de los pilares que sustentarán el Plan Emprendemos 2014-2017 de la Consejería de Industria, Empresa e Innovación.

El Consejo estará compuesto por representantes de varios departamentos del Ejecutivo regional, de la Universidad de Murcia y de la Universidad Politécnica de Cartagena, así como de las cámaras de comercio, empresarios y emprendedores, representantes de empresas de economía social y del cooperativismo, como Amusal y Ucomur, sindicatos, la Unión de Profesionales y Trabajadores Autónomos y la Federación de Municipios, entre otros colectivos.

Todos ellos asistieron con atención a la constitución del Consejo del Emprendimiento, cuyas competencias y funciones serán proponer medidas de mejora de las estructuras productivas, fomento de la cultura emprendedora y apoyo a la consolidación empresarial, además de analizar las necesidades del mercado laboral y lograr fondos europeos.

En su primera reuni√≥n, este √≥rgano abord√≥ la elaboraci√≥n del Plan Emprendemos 2014-2017. El consejero Jos√© Ballesta no concret√≥ a los asistentes el montante del plan porque todav√≠a no se han cerrado los presupuestos regionales, pero avanz√≥ que ¬ęser√° un presupuesto ambicioso¬Ľ, con fondos auton√≥micos, europeos y estatales. El plan ¬ęse sustentar√° en cinco ejes fundamentales: simplificaci√≥n administrativa, coordinaci√≥n, formaci√≥n, mejora de la financiaci√≥n y fomento de la innovaci√≥n e internacionalizaci√≥n¬Ľ.

Tambi√©n desarrollar√° talleres de creaci√≥n de empresas, ponencias de empresarios y jornadas de fomento de la cultura emprendedora en las universidades p√ļblicas. No en vano, los miembros de este √≥rgano consultivo disponen de un plazo de quince d√≠as para aportar propuestas espec√≠ficas al plan. Tales iniciativas ser√°n estudiadas por una comisi√≥n t√©cnica antes de que el Consejo del Emprendimiento se vuelva a reunir en diciembre, de cara al inicio del plan que tendr√° entre sus objetivos relanzar el Parque Cient√≠fico, y convertirlo en un centro neur√°lgico para los emprendedores con proyectos de base tecnol√≥gica.

En definitiva, una oportunidad de impulsar la actividad de este complejo, despu√©s de que la fundaci√≥n que lo gestionaba ,y que estaba compuesta por el Ejecutivo regional, los ayuntamientos de Murcia y Molina de Segura y las universidades p√ļblicas, se disolviese. En la actualidad, el parque cuenta con una p√©sima estad√≠stica, con solo doce empresas innovadoras de base cient√≠fica y tecnol√≥gica, de las cuales, solo dos est√°n instaladas f√≠sicamente en el campus y las diez restantes est√°n inscritas en el registro.

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Nuevo ’software’ para mejorar el diagn√≥stico del da√Īo cardiaco tras un infarto

Octubre 16, 2013 Microciencia No Comments

La herramienta X-QPA permite observar el área de irrigación en rojo. / CVC-UAB

La herramienta X-QPA permite observar el área de irrigación en rojo. / CVC-UAB

FUENTE: SINC

Los investigadores Carlo Gatta del Centro de Visión por Computador (CVC) y Simone Balocco de la Universidad de Barcelona, en colaboración con el doctor Xavier Carrillo del Hospital Universitari Germans Trias i Pujol, han desarrollado una novedosa herramienta informática basada en visión por computador.

Se trata de Quantitative Myocardial Perfusion Analysis (X-QPA) y sirve para cuantificar el da√Īo de los tejidos mioc√°rdicos cuando se requiere una intervenci√≥n ‚Äďpor ejemplo, por infarto o angina de pecho‚Äď, o inmediatamente antes o despu√©s.

El software permite, a través del análisis de imágenes, obtener una medida cuantitativa, repetible y más objetiva de la irrigación miocárdica, identificando las regiones con menor riego sanguíneo. Facilita la comparación rápida entre el estado pre y posoperatorio o entre dos arterias.

Los investigadores consideran que la nueva herramienta puede ayudar a los m√©dicos a mejorar el diagn√≥stico de da√Īo coronario, contribuyendo as√≠ a reducir la mortalidad por enfermedades card√≠acas cr√≥nicas, y a probar nuevos tratamientos para enfermedades card√≠acas isqu√©micas. Su uso tambi√©n supondr√≠a una alternativa a la resonancia magn√©tica, con el consiguiente ahorro de costes y tiempo.

Un prototipo del X-QPA ha sido construido y validado ya en 200 pacientes, gracias a una ayuda econ√≥mica aportada por la agencia ACC1√ď. Tambi√©n se han solicitado la patente a nivel europeo. El pr√≥ximo paso ser√° intentar la comercializaci√≥n de la nueva t√©cnica a trav√©s de una compa√Ī√≠a m√©dica

Las enfermedades cardiovasculares son una de las principales causas de muerte en nuestro país. Entre ellas destaca la cardiopatía isquémica y especialmente el infarto agudo de miocardio, que también presenta un elevado grado de morbilidad. En este caso, el mejor tratamiento es la angioplastia primaria, ya que restablece el flujo coronario normal.

Segunda prueba diagnóstica

Pero se ha demostrado que, incluso cuando esta t√©cnica se realiza con √©xito, la enfermedad del paciente tiene mayores probabilidades de reaparecer en casos en los que la irrigaci√≥n mioc√°rdica se vea afectada tambi√©n en los vasos sangu√≠neos m√°s peque√Īos.

Por eso, a veces el m√©dico ordena una segunda prueba diagn√≥stica al paciente ‚Äďnormalmente una resonancia magn√©tica‚Äď unas semanas despu√©s de la intervenci√≥n para, en caso necesario, prescribir los f√°rmacos convenientes.

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Más allá de la genética: estudio de redes biológicas para dar con tratamientos nuevos

Octubre 15, 2013 Microciencia No Comments

FUENTE: Madri+d

Los genes definen tanto al ser humano como al resto de organismos vivos y contienen información fundamental para generar y mantener las células y legar datos genéticos a sus descendientes que van desde el color de los ojos o del pelo a la propensión o la resistencia a enfermedades.

Sin embargo, los genes no son la √ļnica fuente de informaci√≥n biol√≥gica, pues las prote√≠nas, las redes metab√≥licas y las redes de interacci√≥n entre prote√≠nas y genes, entre otras, podr√≠an contener mucha m√°s informaci√≥n de la que se dispone en la actualidad. Todos estos datos en conjunto podr√≠an dar pie a avances importantes en la investigaci√≥n biom√©dica y en consecuencia a tratamientos nuevos contra distintas enfermedades.

El proyecto financiado con fondos europeos BIONET, Network topology complements genome as a source of biological information, aprovecha la teoría de grafos -una rama de las matemáticas- para modelar interacciones entre redes biológicas y crear algoritmos avanzados que analicen estos datos de gran complejidad.

En el caso de la levadura, por citar un ejemplo, cada c√©lula contiene cerca de seis mil prote√≠nas con alrededor de cincuenta mil interacciones entre ellas. La importancia de la informaci√≥n gen√©tica, que contiene los ‘planos’ de la c√©lula, es enorme pero tambi√©n lo es la de estas interacciones entre prote√≠nas en red pues concretan cada una de las funciones celulares. “Del mismo modo que la construcci√≥n de apartamentos difiere de la de las escuelas o los centros comerciales, la selecci√≥n natural ha ‘escogido’ la estructura de las redes biol√≥gicas para que realicen su funci√≥n biol√≥gica de la mejor manera posible”, explic√≥ la Dra. Nataa Prulj del Imperial College de Londres (Reino Unido), beneficiaria de una subvenci√≥n de inicio (Starting Grant) del Consejo Europeo de Investigaci√≥n (CEI) por valor de 1,6 millones de euros para trabajar en el proyecto BIONET.

La Dra. Prulj y sus colegas aplican matemáticas avanzadas, computación en paralelo y técnicas de minería de datos para descubrir información oculta en la estructura de las redes de interacción genética, las interproteicas, las metabólicas, las de la estructura de las proteínas y las funcionales encefálicas, por nombrar algunas.

Resulta un reto enorme en el que se utilizan corpus enormes y complejos y cuyo an√°lisis inform√°tico precisa una cantidad enorme de horas de computaci√≥n. Para esta labor el equipo cuenta con capacidades y tecnolog√≠as de √°mbitos tan diversos como las matem√°ticas, la computaci√≥n en paralelo, la computaci√≥n cient√≠fica, la miner√≠a de datos, la biolog√≠a y la medicina. “Las descodificaci√≥n de estas redes grandes no resulta sencilla debido a los m√ļltiples problemas que no se pueden abordar desde una √≥ptica inform√°tica”, explic√≥ la Dra. Prulj. “Estas redes biol√≥gicas son muy grandes y contienen, por poner un ejemplo, todas las prote√≠nas y las interacciones conocidas que se crean en una c√©lula. De ah√≠ extraemos informaci√≥n de un tipo de datos biol√≥gicos distintos: la topolog√≠a de las redes biol√≥gicas. La relevancia de esta labor reside en que no existe una fuente √ļnica de datos biol√≥gicos capaz de explicar los procesos necesarios para la vida, por lo que es necesario extraer informaci√≥n de cada una de ellas antes de combinarlas y generar una idea general de los sistemas biol√≥gicos complejos”.

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